在诊断学研究中，我们常借助灵敏度、特异度来评价诊断实验的准确性。但当我们想知道两个诊断方法孰优孰劣时，我们就需要对二者的准确性进行比较。而比较优劣的前提是我们能找到一个金标准，没有金标准时只能比较二者的一致性，并不能分出优劣。这里仅讨论有金标准的情况。

我们从最简单的开始，假设两种待比较的诊断方法均给出阳性、阴性二分类的结果，其准确性的比较和研究设计有关。

先说两个独立样本设计的情况。比如，我们想比较心电图、冠状动脉CT在冠心病诊断方面的灵敏度和特异度。假设我们对n1个研究对象进行了心电图检查和冠状动脉造影（金标准），同时对另外n2个研究对象进行了CT检查和冠状动脉造影。

我们知道灵敏度是在“真病人”（金标准判定的病人）中被诊断为阳性的比例，特异度是“非病人”（金标准排除的病人）中被诊断为阴性的比例。所以，我们根据原始的四格表，列出如下的四格表，作独立样本卡方检验即可。除了独立的设计方案，配对设计也是很常见的。选择n个研究对象，均进行心电图检查、CT和冠状动脉造影。

因为是同一批研究对象，所以a1+c1=a2+c2，b1+d1=b2+d2。比较灵敏度时，我们在“真病人”中找到两种诊断方法的结果，比较特异度时则在“非病人”中，采用配对卡方检验即可。